Choisir une stratégie d'externalisation comporte également quelques risques, plus ou moins importants.

Le premier risque non négligeable découlant d'une externalisation, est celui de la perte de confidentialité des informations.

De plus, les employés ont une perte de connaissance de leur capital immatériel.

L'externalisation doit être murement réfléchie, et le choix du prestataire externe est primordial. La qualité de ce dernier est indispensable pour que la stratégie s'opère de façon optimale.

 Ces risques doivent donc être examiner de très près par l'entreprise souhaitant externaliser une partie ou l'intégralité d'une fonction, sinon la stratégie peut être contre-productive.